報告題目: EGPS 1.0: Comprehensive software for multi-omic and evolutionary analyses
報告人: 李海鵬研究員
中科院計算生物學(xué)重點實驗室
時 間: 9月18日（周三）16：00
地 點: 岳陽路319號信息中心明德廳
摘 要：
組學(xué)數(shù)據(jù)爆發(fā)性增長，而對數(shù)據(jù)的高效挖掘和深度分析卻成為生物學(xué)家面臨的難題。我們開發(fā)了針對生物進(jìn)化和多組學(xué)分析的綜合軟件eGPS（evolutionary Genotype-Phenotype Systems），極大方便了相關(guān)分析。eGPS軟件包括單機(jī)版本和云計算版本，可在不同平臺下運行，且利于開發(fā)，易于應(yīng)用。云計算版本將基因組分析、群體數(shù)據(jù)分析、進(jìn)化數(shù)據(jù)分析、網(wǎng)絡(luò)分析以及圖形可視化這五部分的分析有機(jī)整合起來，實現(xiàn)遠(yuǎn)程云計算功能，方便用戶在缺乏計算資源的情況下快速獲得運算結(jié)果，并最終以圖形、圖表等形式直觀展示。單機(jī)版本可以在無須上傳數(shù)據(jù)的情況下，幫助用戶分析基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的數(shù)據(jù)。同時eGPS Desktop還擁有完善的進(jìn)化分析流程。比如可以直接從基因組序列比對建立物種樹。在eGPS Cloud和其他開放式在線資源的支持下，eGPS Desktop提供了一鍵點擊從候選基因到基因樹的分析流程。相關(guān)程序可從http://www.egps-software.org/免費獲取。
個人簡介：
李海鵬，進(jìn)化基因組學(xué)研究組PI，從事理論群體遺傳學(xué)、生物信息學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)的研究。
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