1月9日下午,中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所所級科學數(shù)據(jù)中心舉辦了“生物醫(yī)學知識圖譜構建技術”培訓,旨在幫助科研人員了解和掌握生物醫(yī)學知識圖譜構建技術。本次培訓由中心高級工程師凌鋆超擔任主講人,凌鋆超的研究方向是生命組學數(shù)據(jù)庫/知識庫建設與生物信息學分析,他目前主要負責健康醫(yī)療和生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫研發(fā)方向的架構設計與研發(fā),研發(fā)了包括中國人群動態(tài)基因組數(shù)據(jù)庫、NODE國家組學數(shù)據(jù)百科全書、PGG.SV結構變異數(shù)據(jù)庫在內的多項生命科學數(shù)據(jù)庫資源。此外,他還作為項目骨干參與了多項國家重點研發(fā)計劃項目,并積累了豐富的項目經驗。曾在Nucleic Acids Research、Science Bulletin、Bioinformatics等期刊發(fā)表多篇基因組學和數(shù)據(jù)庫相關文章。
凌鋆超首先介紹了數(shù)據(jù)庫、知識庫和知識圖譜的概念及區(qū)別,并對知識圖譜進行了基本的介紹。隨后,他介紹了常見的知識圖譜以及知識圖譜的典型應用、構建的關鍵技術、構建知識圖譜的必要性和常見問題。此外,他還詳細介紹了中心已經構建的基于條件的精準藥物知識庫、結核分枝桿菌免疫原知識圖譜等。最后,凌鋆超通過數(shù)據(jù)、大模型和下游任務三個方面對知識圖譜進行了總結和未來發(fā)展展望。
在培訓過程中,學員們積極參與,踴躍發(fā)言,并與凌鋆超就知識圖譜下游預測、如何界定知識的可靠性以及如何解讀知識圖譜等問題進行了深入交流和討論。這次培訓使學員們更深入地了解了所級科學數(shù)據(jù)中心基于大模型和知識模式驅動的條件知識圖譜方面的工作,并了解到中心可以提供的數(shù)據(jù)庫和工具軟件開發(fā)服務,為科學研究提供了有力支持。
營養(yǎng)與健康所所級科學數(shù)據(jù)中心將繼續(xù)舉辦相關主題的培訓活動,以幫助更多的科研人員了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四類服務。同時,所級科學數(shù)據(jù)中心也歡迎科研人員提出寶貴意見和建議,以進一步完善和提升服務質量。通過與科研人員的積極互動和反饋,中心將不斷改進服務流程和技術支持,以滿足科研人員的需求,為科研人員提供更加優(yōu)質的服務。

凌鋆超高級工程師作培訓報告