9月10日下午，中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心舉辦了“生物醫(yī)學(xué)命名實(shí)體識(shí)別及消歧”培訓(xùn)，旨在幫助科研人員了解和掌握生物醫(yī)學(xué)命名實(shí)體識(shí)別及消歧技術(shù)。本次培訓(xùn)由中心莊心昊博士擔(dān)任主講人。
莊心昊首先以新型冠狀病毒數(shù)據(jù)為例，詳細(xì)講解了生物醫(yī)學(xué)命名實(shí)體識(shí)別的概念和基本原理及其重要性。他指出，通過命名實(shí)體識(shí)別消歧，可以實(shí)現(xiàn)高效的信息檢索。培訓(xùn)中，莊心昊介紹了UMLS、BERN、MetaMap等生物醫(yī)學(xué)特有的術(shù)語庫和工具，并探討了命名實(shí)體識(shí)別完成后可以進(jìn)行的一些應(yīng)用，例如構(gòu)建知識(shí)圖譜和提供用藥建議。此外，他還講解了如何從大量文本中定位實(shí)體，從而更全面地理解實(shí)體之間的關(guān)系，并探討了命名實(shí)體識(shí)別消歧在臨床實(shí)驗(yàn)中的應(yīng)用。最后，莊心昊分享了所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心在命名實(shí)體識(shí)別消歧方面的研究成果，包括大模型NER方法、抗原肽識(shí)別及文本訓(xùn)練，同時(shí)他還對(duì)中心開發(fā)中的標(biāo)注系統(tǒng)進(jìn)行了展示。
培訓(xùn)過程中，學(xué)員們積極參與，踴躍發(fā)言，并與主講人進(jìn)行了深入交流和討論。討論內(nèi)容涵蓋了傳統(tǒng)文本識(shí)別與大模型時(shí)代的區(qū)別、如何確定實(shí)體的來源、區(qū)分實(shí)體和屬性、以及不同階段在消歧中的關(guān)注點(diǎn)。
營養(yǎng)與健康所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心將持續(xù)舉辦相關(guān)主題的培訓(xùn)活動(dòng)，以幫助更多的科研人員了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四類服務(wù)。同時(shí)，所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心還設(shè)計(jì)了相關(guān)的調(diào)研問卷（詳見文末二維碼），誠邀科研人員提出寶貴的意見和建議，以便進(jìn)一步優(yōu)化和提升服務(wù)質(zhì)量。通過與科研人員的積極互動(dòng)和反饋，中心將不斷改進(jìn)服務(wù)流程，提升技術(shù)支持質(zhì)量，為進(jìn)一步滿足科研需求提供更加優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。
莊心昊博士作培訓(xùn)報(bào)告
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